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SNP 基因型检测-KASP 检测

KASP 即竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive Allele Specific PCR),可在广泛的基因组DNA 样品中(甚至是一些复杂基因组的DNA 样品),对SNPs 和特定位点上的InDels 进行精准的双等位基因判断。

以KASP 为核心技术,提供灵活适用的基因型分析解决方案,用于基因型分型分析、KASP Assay 的研发、NGS之后的SNP 验证和农业种群研究等。

技术原理及流程


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样品要求及检测周期

样品数量: ≥ 24 个(含空白点2 个)

样品浓度: 200ng/ul-1000ng/ul

样品用量: 至少100ul(检测标记数多于192 个或少于16 个,根据具体检查内容确定)

样品纯度: 无明显杂质、大分子及颜色,OD260/230 大于1

检查周期: 10-15 个工作日

检测平台: LGC® SNPline 基因型分型技术平台、Douglas Array Tape 平台

dhy大红鹰官方网站KASP产品特点

基于KASP技术原理及dhy大红鹰官方网站自身优势,dhy大红鹰官方网站提供检测服务主要有下列特点:

1. KASP试剂为经过优化的PCR试剂,位点特异性扩增强,标记转化率高,可达到90%以上;

2. KASP标记只设计两条特异位点引物和一条通用引物即可,开发简单易行、周期短、成本低;

3. KASP基于荧光分型的,结合微量反应的LGC SNPline和Douglas Scientific Array Tape全自动基因分型平台,检测快速、准确、成本低;

4. 每个PCR只检测一个位点,医学Panel检测可以自由组织,灵活调整,一个批次可检测样品数从数十个到数万个,标记数从数个到数百个;

5. 结合标记/DNA储存管理系统STT3K0、LCG Kraken管理系统、Douglas Scientific Intellics管理系统以及StarLIMS实验室信息管理系统,从样品提交到基因分型,全流程自动化数据跟踪,数据出错概率小,追溯性强;

6. dhy大红鹰官方网站拥有专门的标记开发、基因组DNA提取及质检、SNP检测、数据分析等团队,每个步骤都有标准化的操作流程及相应的质检方案,样品检测准确、重复性强。

KASP检测设备

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Array Tape 的工作流程

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应用领域

真实性检测、基因精细定位、分子标记辅助育种、种质资源分析

结果展示

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参考文献

1. KassaSemagn et al. (2013) Single nucleotide polymorphism genotyping using Kompetitive Allele Specifi c PCR (KaSp): overview of the technology and its application in crop improvement. Molecular Breeding.

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