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液相捕获测序解决方案

液相基因芯片是根据碱基互补配对原则,在液相反应条件下,可针对目标区域序列设计与之互补配对的寡核苷酸探针。通过目标捕获结合高通量二代测序,实现检测感兴趣的基因组区域或位点鉴定(1K-100M)遗传变异的有效方法,具有较高的灵活性和可拓展性,能够经济高效地捕获高覆盖深度下的变异信息。较大地减少了冗余序列。可以更加精准和快速定位与特定性状相关的候选基因进行材料鉴定、优势性状筛选、群体遗传学分析、亲缘关系分析等。

前dhy大红鹰官方网站已经在液相基因芯片靶向捕获技术应用上积累了丰富的技术经验,完成了无参考基因组,单一参考基因组和泛基因组物种三种场景全覆盖的液相基因芯片的开发,检测,分析流程化的技术积累和实现,同时可提供高通量,低成本,高效率的分子育种和科研项目基因分型技术平台搭建和检测服务。

探针设计

液相基因芯片探针杂交技术,可选择性的分离与富集基因组任意区域的特定片段

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技术特点

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位点设计时需提供

1、物种名称;

2、物种的参考基因组数据/链接,如无参考基因组提供转录组信息,自行组装的基因组请备注;

3、位点坐标(bed文件),备选点增加 20%-50%。例,产品定义10K SNP,供设计的位点池至少 12K;

4、目标品种的实测WGS数据(尽量提供,以便质控);

位点筛选时需做注意:

1、位点附近突变数量不宜过多;

2、位点选择可以在全基因组均匀分布;

3、避免高拷贝,重复区域,GC异常,结构变异等;

4、样本品种间差异,尽量选择相对保守的区域;

捕获流程

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Panel定制流程

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支持测序平台:MGI/Illumina
采购灵活:可打包采购,亦可分开采购
Panel订制周期:30个工作日

咨询联系

电话:13910342709 15313080697
邮箱:lianxi@cgmb.com.cn

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