Successful case
科研解决方案
大豆(Glycine max)5K育种芯片包含 4,599 SNP标记,其中 270 为功能标记,4,329 为基因组覆盖标记。
芯片设计要点如下:
1、标记质量高、稳定性高;
2、标记均匀覆盖基因组;
3、标记多态性高;
4、包含开花期、生育期功能标记;
对大豆材料进行大豆5K育种芯片检测,然后可以进行以下分析:
1、通过功能标记对每份材料的开花期等性状进行预测;
2、通过功能标记将优良农艺性状导入现有材料,同时通过背景标记确保原有农艺性状不变;
3、将所有材料进行划群分析;
4、计算所有材料间的遗传相似度;
5、结合表型数据进行基因定位;
6、结合表型数据进行表型预测;
7、进行遗传图谱、遗传多样性、连锁强度等遗传学分析;
8、得到高密度品种指纹图谱,可以结合对照样本进行品种真实性分析;
1、中国科学院东北地理与农业生态研究所
2、中国农业科学院作物科学研究所
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