Successful case
科研解决方案
小麦(Triticum aestivum)15K育种芯片包含 13,947 SNP标记,其中 1,272 为功能标记,12,674 为基因组覆盖标记。
芯片设计要点如下:
1. 标记质量高、稳定性高;
2. 标记均匀覆盖基因组;
3. 标记多态性高;
4. 包含抗赤霉病、抗条锈病、株高、产量、芒长、光周期等功能标记;
对小麦材料进行小麦15K育种芯片检测,然后进行以下分析:
1、通过功能标记对每份材料的赤霉病抗性等性状进行预测;
2、通过功能标记将优良农艺性状导入现有材料,同时通过背景标记确保原有农艺性状不变;
3、将所有材料进行划群分析;
4、计算所有材料间的遗传相似度;
5、计算每份材料与小麦骨干材料的遗传相似度;
6、结合表型数据进行基因定位;
7、结合表型数据进行表型预测;
8、进行遗传图谱、遗传多样性、连锁强度等遗传学分析;
9、得到高密度品种指纹图谱,可以结合对照样本进行品种真实性分析;
1、江苏里下河地区农业科学研究所
2、江苏省农科院
3、南京农业大学
4、西北农林科技大学
5、中国农业科学院作物研究所
6、中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心
7、中国科学院植物研究所
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