Successful case
科研解决方案
水稻(Oryza sativa)8K育种芯片包含 7,519 SNP标记,其中 1,102 为功能标记,6,417 为基因组覆盖标记。
芯片设计要点如下:
1、标记质量高、稳定性高;
2、标记均匀覆盖基因组;
3、标记多态性高;
4、覆盖100多个与水稻重要农艺性状相关联的功能基因;
5、包含籼粳分化SNP标记;
6、包含中花11水稻单株重测序差异较大SNP标记;
对水稻材料进行水稻8K育种芯片检测,然后可以进行以下分析:
1、通过功能标记对每份材料的主要农艺性状进行预测;
2、通过功能标记将优良农艺性状导入现有材料,同时通过背景标记确保原有农艺性状不变;
3、将所有材料进行划群分析;
4、计算所有材料间的遗传相似度;
5、结合表型数据进行基因定位;
6、结合表型数据进行表型预测;
7、进行遗传图谱、遗传多样性、连锁强度等遗传学分析;
8、得到高密度品种指纹图谱,可以结合对照样本进行品种真实性分析;
1、华中农业大学
2、中国水稻研究所
3、中国科学院植物研究所
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